申请东莞二、三类医疗器械许可证需要经过一系列步骤，以确保医疗器械的质量和安全性。以下是申请过程的详细流程方案说明：

第一步： 准备申请材料

申请人需要准备以下材料：《医疗器械注册申报表》、医疗器械产品的申请材料和技术资料、产品注册人的法人营业执照、产品质量保证书等相关证明文件。

第二步：填写申请表格

申请人需要填写《医疗器械注册申报表》，并将申请材料和技术资料一同提交给相关的医疗器械管理部门。

第三步：技术评审

医疗器械管理部门将对提交的申请材料进行审核，并进行技术评审，以确保医疗器械的质量和安全性符合相关标准和法律法规要求。

第四步：现场审核

医疗器械管理部门将安排专业人员对申请人的生产、质量管理体系进行现场审核，以确认其生产能力和质量管理体系符合相关标准和法规要求。

第五步：证书颁发

经过技术评审和现场审核合格后，医疗器械管理部门将颁发《医疗器械注册证》和《医疗器械生产企业许可证》，并将相关信息录入国家药品监督管理部门的医疗器械注册管理平台。

总结：申请东莞二、三类医疗器械许可证的流程包括准备申请材料、填写申请表格、技术评审、现场审核和证书颁发等步骤。申请人需要严格按照规定的流程和要求准备申请材料，并协助医疗器械管理部门做好技术评审和现场审核工作，以确保申请成功并取得相应的许可证。