根据《中华人民共和国营业执照管理条例》规定，公司资质许可证的办理程序通常需要在公司所在地或注册地所属的工商行政管理部门办理。对于东莞地区的企业来说，办理公司资质许可证无疑需要在东莞市的工商行政管理部门进行办理。

东莞作为广东省的一个重要制造业城市，拥有众多企业和工厂，公司资质许可证的办理对于企业来说是非常关键的。在东莞市，企业应首先向当地工商行政管理部门提交相关申请材料，经审核合格后才能获得资质许可证。这意味着企业必须亲自前往东莞市所在地办理公司资质许可证，以确保一切手续顺利进行并取得合法资质。

在办理公司资质许可证的过程中，东莞市工商行政管理部门将严格按照相关法律法规和规定进行审核，确保企业符合法定条件和标准，保障市场秩序和消费者权益。同时，东莞市政府还会积极支持企业的发展，为企业提供便利和支持，促进企业规范经营，提高企业竞争力。

因此，对于在东莞注册或经营的企业来说，办理公司资质许可证必须在东莞市进行，以确保企业合法合规经营，并为企业未来的发展奠定良好基础。企业在办理过程中应遵守法律法规，提供真实有效的资料和信息，积极配合相关部门的审核工作，确保公司资质许可证顺利办理。最终，企业将获得合法的资质许可证，为企业未来的发展增添新的动力和保障。