东莞市的汽车维修备案流程及注意事项如下：

一、汽车维修备案流程：

1. 提交材料：车主需准备好车辆行驶证、车主身份证和维修厂家相关证明文件，如营业执照等。

2. 到指定机构备案：将以上材料带到当地交通管理部门或相关机构，填写备案申请表并提交相关资料。

3. 审核备案：交通管理部门将审核材料，确认车辆及维修厂家信息无误后进行备案。

4. 领取备案证书：审核通过后，车主可取得汽车维修备案证书，有效期一般为一年。

二、汽车维修备案注意事项：

1. 选择正规维修厂家：在进行汽车维修时，应选择有资质、信誉良好的正规维修厂家，确保技术和服务质量。

2. 保留相关证明文件：车主应妥善保管车辆行驶证、备案证书等相关文件，以备日后查验或处理事宜。

3. 定期检查维护：定期对车辆进行检查和维护，确保车辆性能和安全性，避免发生故障。

4. 遵守规定：在进行汽车维修备案时，应遵守相关规定和流程，保证备案的合法有效。

总之，进行汽车维修备案是保障车辆安全和维修质量的重要环节，车主应重视备案流程及注意事项，确保车辆在维修过程中得到相应的保障和监督。