申请东莞二、三类医疗器械许可证是一项复杂的过程，需要提供一系列的资料和遵循一定的流程。下面将就申请流程及所需资料进行解析。

首先，申请人需要准备以下资料：

1. 《医疗器械经营企业申请表》；

2. 企业法人营业执照复印件及加盖公章；

3. 公司章程或证明文件；

4. 申请人的法定代表人身份证明复印件；

5. 申请人具有的生产或经营场所证明文件；

6. 医疗器械注册人或医疗器械网络销售备案凭证；

7. 产品质量检测机构确认的产品质量检验报告。

其次，申请流程如下：

1. 提交申请资料。将上述所需资料提交给当地卫生主管部门；

2. 材料审核。卫生主管部门将对提交的申请资料进行审核，确保符合相关规定；

3. 风险分级。根据医疗器械的功能、用途、风险等级等进行分级；

4. 许可证颁发。当所有资料审核无误后，卫生主管部门将颁发二、三类医疗器械许可证。

需要注意的是，申请人在整个申请流程中应配合卫生主管部门的要求，按规定提交申请资料，并积极配合可能的现场考察及检查。

总之，申请东莞二、三类医疗器械许可证是一项需要严格遵守规定和提供充分资料的过程。希望本文能够为申请人提供一定的帮助。