对于在东莞市注册的公司，若需要注销业务的话，可以在东莞进行办理。注销公司业务涉及到诸多法律程序和文件手续，需要遵循一定的程序，因此建议委托专业的法律服务机构或会计师事务所进行办理，以确保流程的顺利和合规。

在办理公司注销业务时，首先需要在当地工商部门进行注销登记，提交相关资料并缴纳相关费用，包括注销申请书、公司章程、法人身份证明、公司营业执照等文件。此外，还需要清算公司的债务并处理与职工、税务部门等相关的事宜。

此外，还需要办理税务注销、社保注销等相关手续，以确保公司在注销后不再承担任何税务和社保责任。对于员工来说，还需要进行解除劳动合同、结清工资等程序。

在公司注销的整个流程中，需要严格遵循相关法律和政策规定，否则可能会产生一系列的法律风险和影响。因此，建议在办理公司注销业务时，寻求专业的法律和金融咨询服务，以确保一切程序合法合规。

总之，公司注销业务可以在东莞进行办理，但需要遵循一定的程序和手续。为了降低风险，建议委托专业的法律或会计师事务所进行办理，以确保整个注销过程顺利有效。