申请东莞二、三类医疗器械许可证是一项复杂的程序，需要严格遵守相关规定和流程。以下是申请该许可证的流程及注意事项。

一、流程

1. 收集资料：首先，申请人需要准备好各类资料，包括申请表、产品注册证明、生产许可证、产品质量管理体系文件等。

2. 填写申请表：根据要求填写好申请表，并准备好其他必要的申请文件。

3. 递交申请：将填写好的申请表和相关文件递交给当地市场监督管理部门，进行初审。

4. 审核评估：当地市场监督管理部门将对申请人提交的文件进行审核评估，并根据实际情况进行现场检查。

5. 审批发放：经过审核评估后，当地市场监督管理部门将根据情况决定是否发放二、三类医疗器械许可证。

二、注意事项

1. 准备充分：在申请前，申请人需要做好充分的准备工作，包括准备好所需的各类文件和资料。

2. 合规规范：申请人需要严格遵守《医疗器械监督管理条例》等相关法规和规定，确保申请材料的合规和规范。

3. 合理策划：在申请过程中，申请人需要合理策划申请流程，确保每个环节都得到妥善处理。

4. 主动配合：在审核评估过程中，申请人需要积极主动地配合市场监督管理部门进行现场检查和相关工作。

5. 持续跟踪：在申请流程中，申请人需要持续跟踪申请进展情况，及时了解审核进度和结果。

总之，申请东莞二、三类医疗器械许可证是一项需要严谨态度和细致工作的过程。申请人应该严格遵守相关规定和流程，并在申请过程中多加留意。希望上述流程及注意事项对申请人能够提供一定的帮助。